Wine воспринимает системные вызовы Windows-приложений к библиотекам операционной системы и подменяет их своими. Таким образом, полной эмуляции процессора, как в других эмуляторах, типа VMware и Qemu, не происходит, и приложения выполняются в Wine почти так же быстро, как и в «родной» операционной системе (а иногда даже быстрее). Для своей работы Wine не требует наличия установленной ОС Windows, хотя и может использовать её библиотеки. Также Wine предоставляет инструментарий разработки программ Winelib для переноса унаследованных исходных кодов из среды Windows в среду UNIX путём простой перекомпиляции. Wine, безусловно, не является стабильным продуктом, и нельзя сказать, что любую программу для Windows удастся запустить с его помощью. Некоторые подсистемы Windows вообще практически не реализованы.

В дистрибутивах AltLinux используется сборка Wine от компании Etersoft.

На сегодняшний день под Wine работает, как минимум, 1С и Microsft IE, что решает множество проблем с переходом на Linux.